Eigentlich musst Du sie nicht ausführen, sie wird automatisch beim Start der entsprechenden Map geladen. Bei TF2 funktioniert es allerdings nur mit einem Plugin. Weiß jetzt ja nicht welches Spiel bei dir läuft. Es ging normalerweise so das man im Ordner maps einen weiteren Ordner erstellt und diesen cfg nennt. In den Ordner kommen dann die entsprechenden Configs für die maps. Sie müssen den gleichen Namen haben wie die entsprechende map z.B. dust.cfg und da schreibst Du halt alles rein was anders sein soll als das was in der Server.cfg oder sourcemod.cfg steht. Die Mapconfig wird als letztes geladen. Du brauchst nicht den kompletten Inhalt deiner Server.cfg oder sourcemod.cfg nochmal hier rein schreiben sondern nur die Befehle die geändert sein sollen. Es kann auch sein, dass du nicht extra einen cfg Ordner erstellen musst, sondern die Configs einfach mit in den maps Ordner ablegst, bin mir da nämlich nicht mehr so sicher.
Hier mal das Plugin für TF2