Ich selbst hab es nie gemacht. Aber falls du ein wirklich leises System haben willst, kann ich eine Wasserkühlung nur empfehlen. Aleitungen dafür gibt es sehr viele im Netz und mittlerweile kann man es als ausgereift betrachten. Es gibt Kühlkörper für CP'U, GPU, Chipsatz und Festplatten. Das befreit dein System von den kleinen Lüftern. Die Wasserkühlung hat am Wärmetauscher nur einen großen Lüfter, der sich sehr langsam dreht. Theoretisch könnte man den auch nach außen führen und als Kaffeewärmer verwenden. Das würde die Energieeffizienz nochmal steigern
Solltest du dich nicht für die Wasserkühlung entscheiden, könnte dir zwei zusätzliche Lüfter vorne und hinten am Gehäuse helfen den Wärmestau zu beseitigen. Du solltest auch drauf achten, dass du nicht ein allzu großes Kabelwirrwar in deinem PC hat. Das behindert den Luftstrom und sorgt für den Wärmestau. Auch das öffnen der Seitenwand könnte kontraproduktiv sein, da in dem Fall die warme Luft nicht mehr vernünftig hinten ausgeblasen werden kann.